Panathinaikos ile geçirdiği ilk sezonda EuroLeague şampiyonluğu yaşayan Hernangomez, bir sonraki sezonda ise All-EuroLeague İkinci Takımı'na seçildi. Geçtiğimiz sezon deneyimli forvet, 8.0 sayı ve 6.5 ribaund ortalamalarıyla mücadele etti. Hernangomez, Panathinaikos kariyerinde ayrıca bir Yunanistan Ligi şampiyonluğu ve iki Yunanistan Kupası zaferi de yaşadı.