FC Barcelona, Yoan Makoundou ile iki yıllık sözleşme imzaladı. Geçen sezon AS Monaco'nun şampiyonluğa uzandığı Fransa Ligi'nde 20 maça çıkan Makoundou, maç başına 10.1 sayı, 3.4 ribaund ve 1.1 blok ortalaması üretti. Ancak 2025-26 sezonunda Monaco'nun yaşadığı mali sıkıntılar, oyuncunun mart ayı başında kulüpten geçici olarak ayrılmasına neden oldu. Bu süreçte Çin Basketbol Ligi (CBA) ekiplerinden Fujian Sturgeons'a giden Makoundou, burada çıktığı 19 maçta maç başına 15.2 sayı, 6.2 ribaund, 2.1 asist ve 1.5 blok ortalaması yakalayarak dikkat çekici bir performans sergiledi. Mayıs ortasında Monaco'ya geri dönen oyuncu, kulübün şampiyonluk kutlamasına da ortak oldu.

Kariyeri boyunca kiralık olarak da forma giyen Makoundou, 2023-24 sezonunda Karadağ ekibi Buducnost'ta, 2024-25 sezonunda ise Türkiye'de Türk Telekom formasıyla mücadele etmişti.